当研究所は、昌平黌の建学精神である儒学理念を顕彰するために、1999年11月に学術研究機関として設立されました。
本研究所の活動は、1989年（平成元年）6月に建立された大成殿（孔夫子の祠堂）の管理と毎年の孔子祭の企画・実行への参画を通じて、孔子の教化活動を、儒学の精神を、「教育」や「社会」へと、学内及び地域の人々と共に伝え拡げていくことを主な目的としています。特に論語の素読教室を運営することで、儒学の実践活動を学生と一般人に広めています。また、日・韓・中の学者など漢字文化圏を中心とした世界の儒学者たちをお招きして国際シンポジウムを開催し、学術研究誌「儒学文化」を刊行してきました（現在は東洋思想研究所と共同で「研究 東洋」として刊行しております）。